《法医密档》以一个个经典案例为载体，从法医的视角讲述案件侦破的过程，将刑事科学技术与刑侦紧密结合。例如死亡时间的概念，《法医密档》中就会对死亡时间做详细的介绍。法医是通过什么方式，能够精准的推算出死者的死亡时间，进而为刑侦人员提供可靠的破案依据。除了“死亡时间”之外，还有如何确定“死者身份”、如何通过一滴干枯的血迹寻找凶手等等。节目在破解案件的同时，也在传递法医“为死者代言，为生者谋权”的职业精神。

民国，宁城巡捕房接到报案，梁氏商贸公司总经理梁春死在了婚床上。巡捕房的探长伍士德，通过对梁春和惠美童年时期的调查，发现梁春的性刺激使惠美在新婚一大早又一次出现‘晨间僵死’症状。梁春醒过来看到这一现象，以为妻子暴死，童年时被父亲强迫吃生猪肉的经历在他的心灵形成很深的创伤，造成精神上的自我强迫症。大学时吃人体标本事件，又进一步加深了他的病症。所以新婚妻子赤裸的‘尸体’才会给他极其强烈的惊吓冲击，以致气绝身亡。而惠美醒来后看到丈夫暴毙，本来就非常脆弱的心灵根本无法承受这样的现实，就在潜意识里强迫自己遗忘眼前的一切，也就是间歇性失忆，她在无意识的情况下穿上睡衣，离开了新房……

青红两帮为了各自争夺地盘，厮杀不断。黑狼是个职业杀手，干这一行从没失过手。青帮老大何华生花一万大洋雇佣黑狼刺杀自己的竞争对手、红帮老大管荣礼，黑狼经过一番精密的计划，黑狼一枪杀了自以为是管荣礼的何华生，又在懊恼中杀死了自己的女友紫冰，但是他万万没想到雇用自己的刺杀管荣礼的正是管荣礼花钱雇的替身，管荣礼玩了一个碟中谍轻而易举的把自己的对手何华生干掉，就在他自以为可以只手遮天的时候，管荣礼万万没有想到，自己的碟中谍却中了黑狼的反间计，自己雇佣的杀手冷心在杀了黑狼之后给自己带来一封信，管荣礼看完信之后被冷心用同样的方式杀害！一连串的厮杀设局，终逃不过伍士德正义慧眼。

胡维民带着妻子安美丽一起走进了明德大酒店。他们准备去安美丽位于扬州的老家去继承安美丽父亲留下的一大笔遗产。但是路上汽车出了故障，抛锚在了距离扬州并不遥远的宁城里。夜深了，所以他们决定先行住下。但是第二天胡维民修车回来后发现妻子安美丽连其行李都不见踪影，一开始胡维民并没有在意，以为她一会就回来了，但是过了一天了，也没见妻子的踪影，于是他到楼下问服务员妻子的事情，打算报警，但是前台服务员告诉他从未见过他妻子来入住，这让胡维民很是惊讶，于是向巡捕房报案，伍士德通过一系列的调查取证，最终找出凶手、绳之以法！